Förklarat: Vad är den nya AY.12-underlinjen av Delta-varianten, och bör du vara orolig?

Delta-varianten (B.1.617.2) har gett upphov till flera underlinjer som kallas 'Delta Plus'-varianter som bär de flesta av dess karakteristiska mutationer men är olika på andra sätt. En av dessa underlinjer, AY.12, har alla karakteristiska Delta-mutationer utom en.

Människor står i kö för att få en dos Covid-19-vaccin vid ett tillfälligt vaccinationscenter inrättat i en skola i Mumbai, tisdag 17 augusti 2021. (PTI Photo/Kunal Patil)

Eftersom världen nervöst håller reda på alla nya Covid-19-varianter och dess underlinjer, är varje virusprov tekniskt sett en ny 'variant', eftersom dess sekvens inte stämmer överens med sekvensen för något annat virus.

Nu har forskarna utökat Delta-familjen från fyra till 13 varianter. Vissa fall av Delta variant , den vanligaste varianten av oro i Indien, omklassificeras till en annan underlinje - AY.12 - som har associerats med ett stort antal fall i Israel, Indien SARS-CoV-2 Genome (INSACOG) konsortiet, som spårar nya varianter, sades i en rapport.

Men eftersom AY.12-definitionen är inkonsekvent, kommer slutliga siffror att ta lite tid, lyder ett uttalande från konsortiet.

Så, vad är denna AY.12-mutation?

I grunden fungerar viral evolution som vilken annan typ som helst. När viruset sprider sig genom kroppen, gör det kopior av sig själv, som ofta har små misstag och förändringar.

Som sådan har Delta-varianten (B.1.617.2) gett upphov till flera underlinjer som kallas 'Delta Plus'-varianter som bär de flesta av dess karakteristiska mutationer men är olika på andra sätt. En av dessa underlinjer, AY.12, har alla karakteristiska Delta-mutationer utom en.

Antalet fall i Israel är oroande eftersom det är ett land med nästan 60 % av sina vuxna helt vaccinerade och rapporterar att Pfizer-vaccinets effektivitet i det landet är betydligt mindre än vad som framkommit under kliniska prövningar. Omklassificeringen är främst till hjälp för mikroepidemiologi och är inte baserad på förvärv av betydande mutationer. Således är det för närvarande inte känt om AY.12 skiljer sig kliniskt från Delta, noterade INSACOG-rapporten. Inga nya bekymmersamma mutationer noteras i spikeproteinet (S). Dess snabba tillväxt i Israel gör dock att den bör undersökas ytterligare.

Finns det någon skillnad mellan AY.12 och de andra stammarna?

Enligt INSACOG är det ännu inte känt om AY.12 är kliniskt annorlunda än Delta eller B.1.617.2.

Emellertid har AY.12 förlorat några av mutationerna som ses i Delta-linjen, såsom G142D i spikeprotein. Inga nya bekymmersamma mutationer noteras i spikeproteinet i denna variant.

AY.12 är för närvarande den mest dominerande stammen i Israel — 51 procent av de studerade proverna har visat förekomsten av denna variant. Baserat på antalet sekvenser som hittills har laddats upp på GISAID av indiska forskargrupper, har prevalensen av denna variant under den senaste veckan ökat till över 20 procent.

Samtidigt som INSACOG bad stater att vara försiktiga och hålla utkik efter denna variant, sa INSACOG: AY.12, en omfördelad sub-linje av Delta ses i många stater, men siffrorna måste undersökas närmare. Den funktionella effekten av förändringarna mellan Delta och AY.12 är inte känd men de två verkar vara väldigt lika på molekylär nivå.

Hittills, enligt INSACOG, har cirka 70 000 koronavirusprover sekvenserats för deras genomiska struktur, varav 50 000 har tilldelats olika linjer. Cirka 60 % av dem består av internationella varianter av oro eller intresse (VoC eller VoI) som spåras globalt och kopplas till utbrott såväl som fall av vaccingenombrott och återinfektioner. Inom dessa VoC omfattar Delta-varianten 70 % av proverna. Delta plus-fallen, i vilka AY.12 ingår, nummer 67, även om detta förväntas svälla efter omklassificeringen.

nettovärde Kathy Griffin

Följer utvecklingen

Outbreak.org, som spårar nya varianter och deras prevalens, uppger att det första fallet av AY.12-linjen registrerades den 7 september 2020. Sedan dess har 44 083 sekvenser i AY.12-linjen upptäckts över hela världen fram till augusti 26.

Varianten kom dock i förgrunden efter att ha blivit den dominerande stammen i Israel. En fjärde våg av infektioner närmar sig snabbt nivåerna för Israels värsta dagar av pandemin förra vintern. Den dagliga frekvensen av bekräftade nya virusfall har mer än fördubblats under de senaste två veckorna, vilket gör Israel till en stigande hot spot på de internationella topplistorna. Restriktioner för sammankomster och kommersiella och nöjesställen återinfördes denna vecka, och regeringen överväger en ny låsning.

Saken som de flesta experter är oroade över är dock att Israels höga frekvens av infektioner bland tidiga vaccinmottagare kan tyda på en avtagande av vaccinets skydd över tid, ett fynd som bidrog till ett amerikanskt beslut att börja erbjuda booster-shots till amerikaner med stor start nästa gång. månad. Vaccinet kan vara mindre effektivt för att förhindra infektion med den mycket smittsamma A.12 Delta-varianten, nu den primära versionen av viruset i Israel.

Data som publicerades av Israels hälsoministerium i slutet av juli antydde att Pfizer-sprutan bara var 39 % effektiv mot att förhindra infektion i landet i slutet av juni och början av juli, jämfört med 95 % från januari till början av april. Under båda perioderna var dock skottet mer än 90 % effektivt för att förebygga allvarlig sjukdom. Som sådan sätter Israel nu sina förhoppningar på boosterskott.

Enligt Outbreak.org går det första provet av AY.12 i Indien tillbaka till den 7 september 2020.

INSACOG har hittills sekvenserat 67 699 prover av viruset från Indien, varav 50 869 har analyserats i detalj. Ytterligare 11 016 sekvenser av prover har delats av delstatsregeringar - vilket tar det totala antalet sekvenserade prover till 78 865.

Den oroande trenden är dock att eftersom mer än 3,2 miljoner människor hittills har smittats i Indien, har endast cirka 0,002 % av proverna sekvenserats hittills.

Vad är viktigt för allmänheten?

Alla varianter som Världshälsoorganisationen har erkänt är inte lika dåliga. När organisationen ger en ny familj ett namn, lägger den också till en etikett som talar om för oss hur oroliga vi borde vara.

Den lägsta nivån är en variant av intresse, vilket betyder att det är värt att hålla ett öga på. I mitten finns en variant av oro, som Delta, som har utvecklats till att vara farligare. Ofta ges varianter av intresse den etiketten eftersom de delar en mutation med varianter av oro - de är under övervakning. CDC har en extra, allvarligare kategori, en variant med hög konsekvens, som aldrig har getts till en familj av Covid. Det är reserverat för potentiella framtida stammar som kan orsaka allvarlig sjukdom hos vaccinerade personer, misslyckas med att dyka upp på vanliga diagnostiska tester, eller kanske motstå flera behandlingar för covid-symtom.

Mutationer sker slumpmässigt över genomen av virus hos alla de miljoner människor som är infekterade. Några av dessa mutationer dör ut, och några sprids till andra människor. Som sådan håller forskare noga koll på mönster i Delta, särskilt eftersom det sprider sig så snabbt.

Nyhetsbrev| Klicka för att få dagens bästa förklaringar i din inkorg

Dela Med Dina Vänner:

oxiclean nettovärde