Förklarat: Fem steg för att upptäcka coronaviruset (COVID-19)
Processen förklarades för The Indian Express av Dr V Ravi, Senior Professor & Head, Department of Neurovirology, NIMHANS.
Falskt blod ses i provrör märkta med coronaviruset (COVID-19) i denna illustration tagen 17 mars 2020. (Reuters) Dr V Ravi, seniorprofessor och chef, institutionen för neurovirologi, NIMHANS, förklarar processen för att upptäcka coronaviruset för att denna webbplats . Här är de fem stegen:
Samling och transport
Testcentret tar svabbar från näshålan och baksidan av svalget (svalget) och lägger prover i ett virustransportmedium, som innehåller balanserade salter och albumin för att förhindra att viruset sönderfaller. Provet transporteras sedan i kylförvaring till testlabbet.
Charlotte McKinney pojkvän
Extraktion av viralt RNA
Coronavirus som SARS-CoV (som uppstod i Kina 2002-03), MERS-CoV (som dök upp i Saudiarabien 2012), eller den nuvarande SARS-CoV-2 som har orsakat covid-19-pandemin, har stora enkelsträngade RNA-genom. Testlaboratoriet extraherar RNA från proverna med hjälp av kommersiellt tillgängliga kit (som de som tillverkas av företag som QIAGEN.)
Att lägga RNA:et i PCR-blandningen
Extraherat RNA tillsätts till en polymeraskedjereaktion (PCR)-blandning. Detta inkluderar 'mastermixen', som innehåller ett 'omvänt transkriptas'-enzym som omvandlar RNA:t till DNA. Mastermix innehåller Taq-polymeras, enzymet som skapar kopior av DNA:t, nukleotider, såväl som andra element som magnesium - en jon som behövs för att amplifiera DNA:t.
PCR-blandningen innehåller också 'reagenser' såsom 'primers' och 'prober'. Primers är särskilda DNA-strängar som är designade för att binda till det DNA som ska kopieras; sonder används för att detektera den specifika sekvensen i DNA-provet. WHO har rekommenderat specifika primers och sonder för testning för covid-19.
Slutligen består PCR-mixen av en hushållsgen - en normal mänsklig gen (RNase P) som används för att säkerställa att prover samlades in ordentligt och att RNA extraherades.
Amplifiering av viralt DNA
kroy beer man lön
Provet, i sin PCR-blandning, sätts i rör eller plattor, som sedan placeras i en termisk cyklermaskin som används för att utföra PCR-processen.
Först omvandlas RNA:t till DNA. Sedan startar processen att kopiera generna. Den termiska cyklern värmer och kyler blandningen med provet, alternerande mellan tre temperaturer - för att smälta DNA:t för att separera de två strängarna, för att primern ska binda till DNA:t och för att syntetisera en ny sträng - allt inom en cykel som varar en minut. Den termiska cyklern kör 30-40 sådana cykler för att amplifiera DNA:t för att kontrollera viruset.
Testning mot kontroller
Amplifierat DNA testas mot en positiv kontroll, som vanligtvis består av gener från viruset klonade in i plasmiden, och en negativ kontroll, som är ett 'känt' prov som har testat negativt för viruset tidigare.
RNase P ska visa förstärkning, positiv kontroll ska vara positiv, negativ kontroll ska vara negativ, och då är vilket resultat du än får för provet det korrekta resultatet, sa neurovirologen Dr V Ravi. För att ett test ska vara giltigt innan resultatet släpps måste vissa 'validitetskriterier' uppfyllas.
Missa inte från Explained | Hur covid-19-testet fungerar
Om hushållsgenen (RNase P) är positiv, positiv kontroll är positiv, negativ kontroll är negativ och provet inte visar något PCR-positivt resultat, förklaras provet negativt för SARS-CoV-2-virus-RNA. Om PCR-resultatet är positivt har patienten covid-19.
Dela Med Dina Vänner:
är christopher maloney gay
