Förklarat: Hur snabbt sprider sig den nya coronavirusstammen? Kommer det att påverka vaccinationen?

Ny stam av coronaviruset i Storbritannien: Indien och flera andra länder har ställt in flygningar till och från Storbritannien. Vilka mutationer har lett till varianten av coronaviruset som har skapat oro? Hur snabbt har det spridit sig? Och kommer det att påverka vaccinationen?

Flyg från Storbritannien är inställda på Cointrins flygplats i Genève, Schweiz, den 21 december 2020. (Reuters Foto: Denis Balibouse)

På måndag Indien stoppade alla flygningar från och till Storbritannien fram till den 31 december, bland oro över en ny variant av SARS-CoV-2 som sprider sig och växer snabbt där. Flera andra länder har också stängt av Storbritanniens flygningar och infört reserestriktioner.

Vilka är dessa farhågor som leder till resebegränsningar?

Förra veckan avslöjades den nya SARS-CoV-2-varianten som orsaken bakom den snabba ökningen av Covid-19-fall i södra och östra England. Det hänvisas till som VUI (Variant Under Investigation) 202012/01, eller B.1.1.7-linjen.

Under de senaste dagarna har vi, tack vare vår genomiska förmåga i världsklass, identifierat en ny variant av coronaviruset, som kan associeras med den snabbare spridningen i södra England, sade Storbritanniens hälsominister Matt Hancock till House of Commons den 14 december. Brittiska myndigheter har redan meddelat Världshälsoorganisationen om varianten.

Public Health England (PHE) meddelade att 1 108 fall med denna variant har identifierats den 13 december, främst i södra och östra England. PHE arbetar med partners för att undersöka och planerar att dela sina resultat under de kommande två veckorna, sade den.

Howard Cosell barn

Hur är varianten?

Varianten identifierades i genomisk övervakning av COVID-19 Genomics UK (COG-UK), ett konsortium som analyserar genomsekvenseringsdata från Storbritannien. COG-UK är den största bidragsgivaren till den globala Covid-19-databasen GISAID.

Varianten är resultatet av flera mutationer i spikeproteinet av det nya coronaviruset SARS-CoV-2, såväl som mutationer i andra genomiska regioner av RNA-viruset. Preliminär analys tyder på att det är mer överförbart än tidigare cirkulerande varianter. COG-UK identifierade en av dessa mutationer som N501Y, i ett område av spikeproteinet som binder till ett nyckelprotein i den mänskliga cellen, ACE2-receptorn. Detta var en indikation på att förändringarna teoretiskt sett kan leda till att viruset blir mer smittsamt. Ansträngningar pågår för att bekräfta huruvida någon av dessa mutationer bidrar till ökad överföring, sa konsortiet.

Vad vet vi hittills om överföringsförmåga och sjukdomens svårighetsgrad?

På söndagen sa PHE att data från helgenomsekvensering, epidemiologi och modellering tyder på att den nya varianten överför lättare än andra stammar.

Den betonade dock också att det inte finns några bevis för att varianten är mer sannolikt att orsaka allvarlig sjukdom eller dödlighet. … Men vi fortsätter undersökningar för att förstå detta bättre, stod det. Den sa att dödligheten är en eftersläpande indikator och den kommer att kontinuerligt övervaka detta under de kommande veckorna.

PHE har sagt att de ännu inte känner till mekanismen för denna ökning av överföringen. Vi vet att mutationer i spikeproteinet, den del av viruset som gör det smittsamt, kan förändra hur viruset interagerar med mänskliga celler, sa den.

Den sa att bevisen visar att infektionsfrekvensen i geografiska områden där just denna stam har cirkulerat har ökat snabbare än förväntat, och modelleringsbevisen har visat att denna variant har en högre överföringshastighet än andra varianter i nuvarande cirkulation.

Ny stam av coronaviruset i Storbritannien: En polis dirigerar trafiken vid infarten till den stängda färjeterminalen i Dover, England, måndag, efter att hamnen i Dover stängdes. (AP-bild)

Hur mycket oroande är den högre överföringsförmågan?

Den 18 december sa New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG), som ger råd till den brittiska regeringen om hotet från nya och framväxande luftvägsvirus, att den nya varianten potentiellt kan öka reproduktionstalet för sjukdomen med upp till 0,93 . Den sa att den har måttlig förtroende för att den nya varianten visar en avsevärd ökning i överföringsförmåga jämfört med andra varianter.

Expertorganet drog dock slutsatsen att det för närvarande inte finns tillräckligt med data för att dra några slutsatser om den underliggande mekanismen för ökad överföringsförmåga, åldersfördelningen av fall och sjukdomens svårighetsgrad. Det har sagt att 4 dödsfall i cirka 1 000 fall har identifierats, men ytterligare arbete behövs för att jämföra denna dödlighet med jämförbara datauppsättningar.

Placeringen av mutationerna i den receptorbindande domänen av spike-glykoproteinet väcker möjligheten att denna variant är antigeniskt skild från tidigare varianter. Fyra troliga återinfektioner har identifierats bland 915 försökspersoner med denna variant, men ytterligare arbete krävs för att jämföra denna återinfektionsfrekvens med jämförbara datauppsättningar, sade den.

På söndagen, en hotbedömningsrapport publicerad av European Centre for Disease Prevention and Control, sade att fylogenetisk analys avslöjar att klustret skiljer sig med 29 nukleotidsubstitutioner från den ursprungliga Wuhan-stammen. Tre sekvenser från Danmark och en från Australien, från prover som samlades in i november 2020, klusterar med den brittiska varianten, vilket troligen indikerar att internationell spridning har inträffat, även om omfattningen fortfarande är okänd, sade den.

Ny stam av coronaviruset i Storbritannien: Port of Dover stänger när EU-länder inför ett reseförbud från Storbritannien. (Reuters foto)

Men har viruset inte muterat tidigare?

Närhelst ett virus replikerar och cirkulerar i en mänsklig population, sker mutationer naturligt, med en hastighet av cirka en till två mutationer per månad i den globala fylogenin.

Faktum är att för SARS-CoV-2 säger COG-UK att det för närvarande finns cirka 4 000 mutationer i spikeproteinet. Varianten D614G var tidigare den dominerande stammen eftersom den spred sig väldigt lätt. En annan stam som har sitt ursprung i spanska lantarbetare, 20A. EU1, spred sig snabbt över Europa på sommaren.

margot robbie nettovärde 2017

Det är svårt att förutsäga om någon given mutation är viktig när den först dyker upp, mot bakgrund av den kontinuerliga uppkomsten av nya mutationer. Att förstå deras betydelse kan vara möjligt baserat på experimentellt arbete som visar en koppling mellan mutationen och en subtil förändring i virusbiologin. Men det skulle ta avsevärd tid och ansträngning att testa effekten av många tusen kombinationer av mutationer, sa COG-UK.

Kommer det att påverka vaccinutveckling och respons?

På söndagen sa brittiska myndigheter att ytterligare laboratoriearbete genomförs som en prioritet för att förstå detta. Det finns för närvarande inga bevis som tyder på att Pfizer-vaccinet inte skulle skydda människor mot den nya stammen, sa PHE.

Dela Med Dina Vänner: