Förklarat: Vad är 'CT-värde' i ett Covid-19-test, och varför är det viktigt?

Cykeltröskelvärdet framkommer i RT-PCR-tester för coronaviruset och avgör om en person är positiv för Covid-19 eller inte. I vilken utsträckning korrelerar det med virusmängd och sjukdomens svårighetsgrad?

Ett RT-PCR-test upptäcker viruset; Ct-värdet sätter ett riktmärke för om en person ska räknas som positiv. (Expressfoto: Amit Mehra)

Bland olika vetenskapliga termer som Covid-19-pandemin har gjort till en del av det allmänna ordförrådet, är en 'Ct-värdet' i RT-PCR-tester för att avgöra om en patient är positiv för Covid-19.

Detta var föremål för en nyligen skickad begäran från Maharashtras regering till Indian Council of Medical Research (ICMR). Staten sökte klarhet om det var tillrådligt att behandla en person som covid-negativ om Ct-värdet är högre än 24 och personen är asymtomatisk. Statliga tjänstemän sa att olika ICMR-dokument hade nämnt olika Ct-värden och att det fanns olika åsikter även bland Niti Aayog och National Center for Disease Control.

Dagar senare skrev ICMR DG tillbaka till statens hälsosekreterare att ICMR har tagit in uppgifter från virologilaboratorier över hela landet för att komma fram till ett enda Ct-värde. Alla patienter med ett Ct-värde mindre än 35 kan betraktas som positiva medan de med ett Ct-värde över 35 kan betraktas som negativa, sa ICMR.

Men vad är Ct-värdet?

Förkortning för cykeltröskel, Ct är ett värde som framkommer under RT-PCR-tester, guldstandarden för upptäckt av SARS-CoV-2 coronavirus. I ett RT-PCR-test extraheras RNA från pinnen som samlats in från patienten. Det omvandlas sedan till DNA, som sedan amplifieras. Amplifiering hänvisar till processen att skapa flera kopior av det genetiska materialet - i det här fallet DNA. Detta förbättrar testets förmåga att upptäcka förekomst av virus. Amplifiering sker genom en serie cykler - en kopia blir två, två blir fyra, och så vidare - och det är efter flera cykler som en detekterbar mängd virus produceras.

Enligt ICMR-rådgivningen är Ct-värdet för en RT-PCR-reaktion antalet cykler vid vilka fluorescens av PCR-produkten är detekterbar utöver bakgrundssignalen. Enkelt uttryckt hänvisar Ct-värdet till antalet cykler efter vilka viruset kan detekteras. Om ett högre antal cykler krävs, innebär det att viruset blev oupptäckt när antalet cykler var lägre. Ju lägre Ct-värde, desto högre virusmängd – eftersom viruset har upptäckts efter färre cykler.

Nyhetsbrev| Klicka för att få dagens bästa förklaringar i din inkorg

Varför är CT-värde viktigt?

För att sätta det i ett sammanhang, låt oss titta på ICMR-rådgivningen och Maharashtras brev till ICMR. Enligt ICMR anses en patient vara Covid-positiv om Ct-värdet är under 35. Med andra ord, om viruset är detekterbart efter 35 cykler eller tidigare, anses patienten vara positiv. Om riktmärket skulle sänkas till 24 – det värde som nämns i Maharashtras brev – skulle det innebära att Ct-värden i intervallet 25-34 inte skulle anses vara positiva. Ett riktmärke på 35 betyder därför att fler patienter skulle anses vara positiva än vi skulle få om riktmärket var 24. ICMR har sagt att en sänkning av Ct-tröskelparametern kan leda till att flera smittsamma personer saknas.

Man kan tänka på Ct-värdet som ett mått på överföringspotential, sa den ledande virologen Dr Shahid Jameel. Så om det finns mer virus i min hals och näsa, kommer jag att överföra det bättre, säger Dr Jameel, som är chef för Trivedi School of Biosciences vid Ashoka University.

Vad är betydelsen av ICMR-tröskeln på 35?

Globalt sett ligger det accepterade gränsvärdet för Ct-värdet för Covid-19 mellan 35 och 40, beroende på instruktioner från respektive tillverkare av testutrustning. ICMR har kommit fram till Ct-värdet på 35 baserat på laboratorieerfarenheter och input från flera virologilabb.

Det fanns ingen ny rådgivning, men ICMR informerade Maharashtra-regeringen att det inte var tillrådligt att använda en lägre cykeltröskelparameter eftersom det skulle leda till att flera smittsamma personer saknas och öka överföringen av sjukdomar, har Dr Balram Bhargava, GD för ICMR, sagt.

Finns det något samband mellan ett Ct-värde och sjukdomens svårighetsgrad?

Nej. Även om Ct-värdet är omvänt korrelerat med virusmängd, har det inte någon betydelse för sjukdomens svårighetsgrad, har experter sagt. En patient kan ha ett lågt Ct-värde, vilket innebär att hennes virusmängd är tillräckligt hög för att upptäckas snabbt, men hon kan fortfarande vara asymptomatisk.

Tom Petty nettovärde

En liten studie publicerad i Indian Journal of Medical Microbiology i januari i år fann att det inte fanns någon korrelation mellan Ct-värden och sjukdomens svårighetsgrad eller dödlighet hos patienter med Covid-19-sjukdomen. Man fann att tiden sedan symtomdebuten har ett starkare samband med Ct-värden jämfört med sjukdomens svårighetsgrad.

Ct-värdet berättar om virusbelastningen i halsen och inte i lungorna, säger Dr Parikshit Prayag, konsult för infektionssjukdomar vid Deenanath Mangeshkar Hospital, Pune. Ct-värdet korrelerar inte med svårighetsgrad – bara med smittsamhet. I den första rapporten tittar jag inte riktigt på Ct-värdet, men för uppföljning av patienter på sjukhuset överväger jag Ct-värdet, då jag då kan bestämma om jag ska flytta patienten till den icke-Covid-byggnaden eller inte . Ur smittsamhetssynpunkt kan det spela roll, inte svårighetsgraden, sa Dr Prayag.

Betyder ett högt Ct-värde alltid en låg virusmängd?

Även om det kan vara den uppenbara slutsatsen, betonar vissa experter att vissa patienter kan ha ett högt Ct-värde och ändå ha en mycket betydande nivå av Covid-19-infektion, och vice versa. Många faktorer är viktiga för att tolka ett RT-PCR-test, och resultaten kan också bero på provtagningsmetoden och tiden från infektion till insamling och till analys.

En ICMR-rådgivning i augusti förra året noterade att Ct-värden beror på hur provet har samlats in. Ett dåligt insamlat prov kan återspegla olämpliga Ct-värden. Dessutom bestäms Ct-värden också av den tekniska kompetensen hos den som utför testet, kalibrering av utrustningen och tolkarnas analytiska förmåga.

Återigen kan Ct-värden skilja sig mellan nasala och orofaryngeala prover som tagits från samma individ. Transporttemperaturen, såväl som tiden från insamling till mottagande i labbet, kan också påverka Ct-värdena negativt.

Dela Med Dina Vänner: